Apariţia forţelor aeriene la începutul secolului XX a marcat un salt semnificativ al nivelului securităţii generale, ca protector pentru realizările economice, sociale şi pentru viaţa oamenilor. În acelaşi timp însă, acestea (forţele aeriene) au adăugat o nouă ameninţare la adresa societăţii umane prin exponenţializarea efectelor distructive ale războiului şi prin extinderea acestuia până la limite neafectate până atunci, deşi se preconiza un impact cu totul diferit (delegatul american la Conferinţa de la Haga din 1899 aprecia că „Aeronavele militare, după ce se vor perfecţiona, se vor dovedi utile omenirii scurtând războiul şi făcându-l mai puţin distrugător”).

Din perspectiva totalităţii mijloacelor chemate să lucreze în domeniul aerului, înglobate generic în conceptul de putere aeriană, aviaţia, principalul element aerian dinamic, reuşeşte să facă cea mai rapidă şi mai frumoasă carieră în armatele lumii, avansând cu rapiditate, de la stadiul de mijloc auxiliar de informaţie în anii 1910-1914, armă auxiliară de informaţie şi de luptă în anii 1914-1916, armă principală de luptă în 1918, armă a aerului independentă, în concepţiile şi organizarea marilor armate după Primul Război Mondial, la cel de armată a aerului, separată (uneori cu componente integrate) şi pe picior de egalitate cu celelalte forţe armate de uscat şi de apă, în ansamblul puterii militare a unui stat, prin caracteristicile şi proprietăţile ei foarte distincte, ce-i definesc complet valoarea şi puterea.

Transportul personalului, al tehnicii şi materialelor pentru îndeplinirea misiunilor specifice se executa pe căile rutiere şi feroviare ale României, necesitând costuri impresionate şi mari întârzieri datorate stării materialului rulant, a căilor de acces şi condiţiilor meteo nefavorabile.

În vederea micşorării timpului de aprovizionare cu materiale specifice îndeplinirii misiunilor de luptă, înaintea şi pe timpul celui de-al doilea război mondial, au fost constituite în cadrul structurilor luptătoare de aviaţie formaţiuni specifice de transport, prin adaptarea avioanelor de bombardament şi de cercetare-observare.

După terminarea războiului, în anul 1949, potrivit Ordinului Marelui Stat Major nr. 45790 din 03.06.1949 şi Ordinului de Zi al Comandamentului Aviaţiei nr. 136 din 05.08.1949 ia fiinţă, la Giuleşti, Regimentul 8 Aviaţie (Transport).

Regimentul, aflat în subordinea Comandamentului Aviaţiei, era dislocat pe aerodromul de la OTOPENI cu misiunea de a executa transporturi aeriene în folosul Aviaţiei Militare şi a Armatei României.

Aceste schimbări esenţiale produse în structurile organizatorice, vizau trecerea de la componentele tradiţionale ale Aeronauticii Regale Române, consacrate în război, de tip flotilă, grup, etc. spre structuri specifice aviaţiei sovietice de tip regiment. Prin Ordinul Marelui Stat Major nr. 45171/1949, Comandamentul Aeronauticii a primit denumirea de Comandamentul Aviaţiei, s-a trecut de la flotile la regimente de aviaţie şi s-au constituit, în perioada de început, detaşamentele de spate, denumire care se va schimba ulterior în batalion de deservire aerodrom (B.D.A.), apoi bază tehnică de aerodrom (B.T.A.).

În primăvara anului 1950, prin Ordinul Marelui Stat Major nr. 121134, Aviaţia Militară a primit denumirea de Forţele Aeriene Militare, iar comandamentul, Comandamentul Forţelor Aeriene Militare, având în subordine şi Regimentul 8 Aviaţie (Transport).

În baza Ordinului Marelui Stat Major nr.00319530 din data de 27.11.1951, Regimentul 8 Aviaţie (Transport), având în dotare aeronave de tipul LI-2, IL-14 şi IL-18,  îşi schimbă denumirea în Regimentul 108 Aviaţie Transport. Cu această ocazie, în baza decretului preşedintelui Republicii Populare Române nr.353, unitatea primeşte Drapelul de luptă decorat cu Ordinul Apărarea patriei, clasa a III-a.

În conformitate cu prevederile Ordinului Statului Major General nr. C.L.-0011 din 10.01.1959 se înfiinţează Regimentul 99 Aviaţie Transport, prin transformarea Regimentului 108 Aviaţie Transport, având în dotare aeronave de tipul IL-18, AN-2, AN–24 şi AN-26.

Pentru a face faţă cerinţelor tot mai diversificate ale armei, Regimentul 99 Aviaţie Transport a suferit mai multe transformări structurale şi a diversificat activităţile de transport din Aviaţia Militară, astfel:

– în anul 1980, conform Ordinului Marelui Stat Major nr. P.R.00682 Regimentul 99 Aviaţie Transport s-a contopit cu Baza Tehnică de Aerodrom Otopeni în scopul refacerii într-un timp cât mai scurt a capacităţii de operare a aeronavelor din înzestrare;

– în perioada 1986-1988, Regimentul 99 Aviaţie Transport intră în organica Flotilei 50 Aviaţie Transport;

– în perioada 1988-1990 Regimentul 99 Aviaţie Transport acţionează ca structură independentă, sub denumirea de Grupul 99 Aviaţie Transport, având în dotare aeronave de tipul BN-2, AN-2, AN-24, AN-26, AN-30, IAR-316, MI-8.

Perioada de după evenimentele din decembrie 1989 a fost marcată, la nivelul unităţilor din Aviaţia Militară, de modificări structurale, în conformitate cu noile concepţii de întrebuinţare a aviaţiei în operaţie şi necesitatea redimensionării organismului militar.

În cadrul acestui proces, Grupul 99 Aviaţie Transport a fost reorganizat şi transformat, în baza Ordinului Marelui Stat Major nr. B.3/0504 din 10.03.1990, în Baza 99 Transport Aerian.

În baza Ordinului Marelui Stat Major B.3/0633 din 21.03.1990, Baza 99 Aviaţie Transport preia în structura sa forţele şi mijloacele Flotilei 50 Aviaţie Transport şi se transformă în Baza 90 Transport Aerian.

Pentru rezultatele remarcabile obţinute în îndeplinirea misiunilor încredinţate şi ca recunoaştere a rolului şi locului acestei prestigioase unităţi în cadrul Forţelor Aeriene şi Armatei României, prin Decretul Prezidenţial nr. 155 din 30 mai 1995,  Bazei 90 Transport Aerian i-a fost acordat titlul onorific „Comandor aviator GHEORGHE BĂNCIULESCU” şi înmânat Drapelul de Luptă.

Începând cu anul 1990, Baza 90 Transport Aerian, pe lângă existenţa aeronavelor de tipul BN-2, AN-2, AN-24, AN-26, AN-30, IAR-316, MI-8, a început să fie înzestrată cu  avioane de tipul IL-18, Boeing 707, BAC 1-11 şi elicoptere IAR-330, MI-17, SA-365.

În anul 2004, în organica Bazei 90 Transport Aerian au intrat elicopterele IAR-330 SOCAT, rezultate prin desfiinţarea Regimentului 71 Elicoptere Titu.

În afară de tipurile de aeronave prezentate mai sus, începând cu 25 octombrie 1996, aviaţia militară de transport a făcut un pas spre realizarea interoperabilităţii cu forţele NATO, prin înzestarea, în premieră naţională, cu 2 (şi ulterior alte 3) avioane C-130, care au dublat capacitatea de transport şi raza de acţiune.

Un moment important în istoria unităţii a fost ziua de 12.04.2010 când în prezenţa întregului personal au aterizat primele două aeronave C 27 J SPARTAN, primul dintre ele având la bord pe şeful Statului Major al Forţelor Aeriene, iar ambele având la manşă piloţi români. Astfel se consemnează momentul intrării acestui tip de aeronavă în dotarea Forţelor Aeriene Române.

În baza Dispoziţiilor  Statului Major General nr.G/S-688 şi 689 din 21.05.2010, se înfiinţează Flotila 90 Transport Aerian, prin transformarea Bazei 90 Transport Aerian, cu misiunea de a participa la transportul aerian tactic şi strategic, la constituirea pachetelor de forţe dislocabile şi la sprijinul instituţiilor statului şi autorităţilor locale în situaţii de urgenţă civilă.

Prin Ordinul ministrului apărării naționale nr. M.061 din 03.06.2013, de la data de 01.12.2013, Flotila 90 Transport Aerian se transformă în Bazei 90 Transport Aerian.

De la înfiinţare şi până în prezent, personalul din cadrul unităţii a participat la diverse misiuni şi activităţi, printre care amintim:

– 04-19.10.1996: primul exerciţiu aerian „COOPERATIVE KEY”, organizat de Comandamentul Sud-European al Forţelor Aeriene Aliate COMAIRSOUTH, fiind şi primul exerciţiu de acest gen desfăşurat într-o ţară membră a Parteneriatului pentru Pace.

La exerciţiu au participat patru state membre NATO (Italia, Turcia, SUA şi Grecia) şi patru state partenere (România, Slovacia, Moldova şi Slovenia). Exerciţiul a încheiat în premieră un ciclu de trei exerciţii, desfăşurat în toate cele trei medii (terestru – „COOPERATIVE DETERMINATION ’96″; maritim – „COOPERATIVE PARTNER ’96″) într-un singur an calendaristic;

– 11-26.10.1997 s-a desfăşurat o misiune istorică pentru Aviaţia Militară şi pentru Baza 90 Transport Aerian, având loc zborul unui avion C-130 pe ruta Otopeni-Marietta (Atlanta – SUA) – Otopeni, cu traversarea Oceanului Atlantic;

– anul 2005: se execută misiunea ALTHEA în Bosnia Herţegovina executată cu elicopterele IAR-330 SOCAT, în două rotaţii a câte 6 luni (Detaşamentele ALFA şi BRAVO), ceea ce a constituit o premieră de mare importanţă pentru Forţele Aeriene, fiind prima misiune multinaţională în afara graniţelor ţării, executată sub conducerea UE;

– anul 2009: certificarea aeronavei AN-30 ca platformă naţională pentru misiuni în cadrul tratatului OSCE, „Cer Deschis”. Astfel această aeronavă poate executa acest tip misiuni atât în folosul României, dar şi în regim de închiriere pentru alte state ca Germania sau Marea Britanie;

– anii 2015-2021: RESOLUTE SUPPORT MISSION – Afganistan;

– anul 2018: Sprijin logistic pentru activitățile de stingere a incendiilor – Grecia;

– anul 2019: Comemorarea a 75 de ani de la Debarcarea în Normandia – Franța;

– anul 2020: Misiuni umanitare de transport în sprijinul societății civile în contextul pandemiei de COVID-19 (Turcia, Germania);

– anul 2023: Sprijin logistic pentru detașamentul românesc CARPATHIAN VIPERS care a asigurat serviciul de poliție aeriană în țările Baltice – Lituania;

– anul 2023: MILEX 2023 – Sprijin logistic – Spania;

– anul 2023: COMBINED RESOLVE XIX – Sprijin logistic – Germania.

Suplimentar, față de misiunea de bază, escadrilele de transport ale Bazei 90 Transport Aerian au executat misiuni de evacuare medicală, evacuarea non-combatanților din zonele de conflict, de căutare-salvare, stins incendii, desant aerian, inserții, misiuni speciale și nu în ultimul rând de cercetare la vedere și prin aerofotogrammetrie.

În data de 15 septembrie 2023 aeronava C-130H2 cu înmatricularea 91-9142 a fost transferată cu titlu gratuit din excedentul Forțelor Aeriene SUA către România, aeronava aterizând pe aeroportul internațional Otopeni.

În data de 3 noiembrie 2023 Forțele Aeriene Române au primit, tot în baza programului și acordului menționat mai sus, aeronava C-130 Hercules H2 înmatriculată 91-9143 care a intrat în serviciu operațional în cadrul Escadrilei 901 Aviație Transport Strategic. Aeronava a fost transferată cu titlu gratuit din excedentul Forțelor Aeriene SUA.

Prin Decretul prezidențial nr. 475 din 30.05.2019, drapelul de luptă al Baza 90 Transport Aerian a fost decorat cu „Ordinul Virtutea Aeronautică în grad de ofițer”.

Prin decretul prezidențial nr. 872 din 20.07.2021, drapelul de luptă al Bazei 90 Transport Aerian a fost decorat cu Ordinul militar de război “Virtutea aeronautică în grad de cavaler”.

Începând cu decembrie 2013, prin reînființarea Bazei 90 Transport Aerian, misiunea acesteia este de a participa la transportul aerian în teatrele de operaţii, la transportul aerian potrivit nevoilor FA, la sprijinul instituţiilor statului şi autorităţilor locale în situaţii de urgenţă civilă, iar la ordin, sprijinul manevrei de forţe şi mijloace.